Atribacter
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| Domaine | Bacteria |
|---|---|
| Phylum | Atribacterota |
| Classe | Atribacteria |
| Ordre | Atribacterales |
| Famille | Atribacteraceae |
Atribacter est un genre de bactéries de la famille des Atribacteraceae.
Historique[modifier | modifier le code]
La souche type de ce genre Atribacter est isolée au large du Japon à partir d'un mélange de sédiments et d'eau prélevés de sédiments profonds d'un aquifère salin comprenant du gaz naturel[2].
Description[modifier | modifier le code]
Les bactéries du genre Atribacter sont gram négatives et anaérobies stricts. Elles ne formant pas de spores, sont en forme de bacilles et parfois aussi plus ovoïde avec des extrémités plus pointues[2]. Leurs dimensions caractéristiques sont de 0,6 à 0,8 μm de large et de 1,3 à 1,8 μm de long[3]. Contrairement à la plupart des bactéries gram négatives, les Atribacter possèdent trois bicouches lipidiques[2].
En culture, ces bactéries forment des colonies brun clair, circulaires et convexes. La croissance de ces bactéries est optimale à 45 °C, pH 7.3 et avec une salinité de 0,1 M mais elle peut se produire aussi dans des intervalles de 20 à 50 °C, pH de 6,4 à 8,2 et 0,01 M à 0,6 M[3]. La culture de des bactéries de ce genre nécessite la présence d'extrait de levure tandis que la peptone et les acides casaminés ne la stimulent pas[3]. Cette culture peut aussi être améliorée avec un méthanogène piégeur d'hydrogène[3].
La croissance est possible avec les sucres suivants : cellobiose, fructose, galactose, glucose, mannitol, mannose, pectine, raffinose, rhamnose, saccharose, sorbitol, xylose. La dégradation du glucose produit de l'acétate, de l'hydrogène et du dioxyde de carbone. Atribacter laminatus n'utilise pas les sucres suivants : amidon, arabinose, cellulose, gélatine, lactose, maltose, mélibiose, ribose, tréhalose[3].
La respiration anaérobie n'est pas observée avec le nitrate, le sulfate ou l'ion Fe(III)[4].
Le pourcentage en bases GC de laDN est de 38,69 %[4].
Taxonomie[modifier | modifier le code]
Le nom correct complet (avec auteur) de ce taxon est Atribacter Katayama et al. 2021[5].
L'espèce type est : Atribacter laminatus Katayama et al. 2021[5],[4].
Étymologie[modifier | modifier le code]
L'étymologie de ce genre est la suivante : A.tri.bac’ter. L. masc. adj. ater, noir; N.L. masc. n. bacter, un bacille; N.L. masc. n. Atribacter, une bactérie noire, appartenant au nom de phylum “Ca. Atribacteria” original[5].
Liste des espèces[modifier | modifier le code]
Selon la base taxonomique LPSN[5] :
- Atribacter laminatus Katayama et al. 2021[1]
Références[modifier | modifier le code]
- Katayama et et al. 2020.
- Katayama et et al. 2020, p. 2.
- Katayama et et al. 2020, p. 6.
- Katayama et et al. 2020, p. 5.
- (en) « Genus Atribacterac », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (consulté le )
Bibliographie[modifier | modifier le code]
- Publication originale (en) Taiki Katayama, Masaru K. Nobu, Hiroyuki Kusada, Xian-Ying Meng, Naoki Hosogi, Katsuyuki Uematsu, Hideyoshi Yoshioka, Yoichi Kamagata et Hideyuki Tamaki, « Isolation of a member of the candidate phylum ‘Atribacteria’ reveals a unique cell membrane structure », Nature Communications, vol. 11, no 1, , p. 6831 (lire en ligne)
- (en) Aharon Oren et George M. Garrity, « Validation list no. 199. List of new names and new combinations previously effectively, but not validly, published », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol. 71, no 5, , p. 4773 (DOI 10.1099/ijsem.0.004773)
Liens externes[modifier | modifier le code]
- (fr + en) Référence GBIF : Atribacter (consulté le )
- (en) Référence LPSN : Atribacter Katayama et al. 2021 (consulté le )
