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Jeffrey Hall est né le à Brooklyn[1], à New York, et a grandi dans la banlieue de Washington D.C., tandis que son père travaillait comme journaliste pour Associated Press, couvrant le Sénat américain. Le père de Hall, Joseph W. Hall [6], l'a fortement influencé, notamment en encourageant Hall à se tenir au courant des événements récents dans le quotidien. Hall a fréquenté l'école secondaire Walter Johnson à Bethesda, dans le Maryland, où il a obtenu son diplôme en 1963 [7]. En tant que bon élève du secondaire, Hall prévoyait poursuivre une carrière en médecine. Hall entame des études de baccalauréat au Amherst College en 1963. Cependant, au cours de ses études de premier cycle, Hall se passionne pour la biologie [3]. Pour son projet principal, acquérir de l'expérience dans la recherche formelle, Hall a commencé à travailler avec Philip Ives. Hall a rapporté qu'Ives était l'une des personnes les plus influentes qu'il ait rencontrées au cours de sa jeunesse. [8] Hall a été fasciné par l'étude de Drosophila alors qu'il travaillait dans le laboratoire d'Ives, une passion qui imprègne ses recherches. Sous la supervision d'Ives, Hall étudia la recombinaison et l'induction de la translocation chez Drosophila. Le succès des recherches de Hall poussa le corps professoral du département à lui recommander de poursuivre ses études supérieures à l'université de Washington à Seattle, où un département entier était consacré à la génétique.
(en) Faits saillants sur le site de la fondation Nobel (le bandeau sur la page comprend plusieurs liens relatifs à la remise du prix, dont un document rédigé par la personne lauréate — le Nobel Lecture — qui détaille ses apports)