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Histoire
Fondation	4 novembre 1988
Sigle	(en) NCBI
Type	Institut de recherche, bibliothèque de données
Siège	Bethesda
Pays	États-Unis
Coordonnées	38° 59′ 45″ N, 77° 05′ 56″ O
Organisation mère	United States National Library of Medicine
Site web	(en) www.ncbi.nlm.nih.gov

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Le National Center for Biotechnology Information (NCBI, littéralement en français : « Centre américain pour les informations biotechnologiques ») est un institut national américain pour l'information biologique moléculaire.

Historique[modifier | modifier le code]

Cet organisme, fondé en 1988 et situé à Bethesda dans le Maryland, fait partie de la Bibliothèque américaine de médecine, un des Instituts américains de la santé.

Missions[modifier | modifier le code]

Le NCBI conduit des recherches dans la biologie informatique, développe des logiciels pour analyser des données de génome et fournir des informations biomédicales.

Le NCBI n'est pas une base de données, mais il développe aussi des bases de données publiques telles que :

Il est en quelque sorte le pendant américain de l’Institut européen de bio-informatique (EBI).

Le NCBI propose et contient une base de données NCBI taxonomy qui n'est qu'indicative. Le site internet du NCBI précise que cette base n'est pas une source fiable pour la nomenclature ou de classification, et qu'il faut consulter la littérature scientifique pertinente pour les informations les plus fiables^[1]. La taxonomie du NCBI représente environ 10 % des espèces vivantes de la planète. Cette taxonomie est une classification curée et se propose comme une nomenclature organisée pour les séquences d'organismes dans des bases de données publiques^[2].

Le TaxID (identifiant unique dans la taxonomie du NCBI) sert de lien entre les trois bases de données du International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC, en français : « Collaboration internationale en bases de données de séquences nucléotidiques »)^[3] dont sont membres la DNA Data Bank of Japan (DDBJ), le NCBI (États-Unis) et l'Institut européen de bio-informatique (EMBL-EBI, Europe)^[4].

Notes et références[modifier | modifier le code]

↑ (en) « Disclaimer: The NCBI taxonomy database is not an authoritative source for nomenclature or classification - please consult the relevant scientific literature for the most reliable information. » (Voir bas de page sur cet exemple de recherche.)
↑ (en) « Home - Taxonomy », sur ncbi.nlm.nih.gov (consulté le 30 août 2017).
↑ (en) Scott Federhen, Karen Clark, Tanya Barrett et Helen Parkinson, « Toward richer metadata for microbial sequences: replacing strain-level NCBI taxonomy taxids with BioProject, BioSample and Assembly records », Standards in Genomic Sciences, vol. 9, n^o 3,‎ 15 juin 2014, p. 1275 (ISSN 1944-3277, DOI 10.4056/sigs.4851102, lire en ligne, consulté le 30 août 2017).
↑ (en) « International Nucleotide Sequence Database Collaboration », sur insdc.org (consulté le 30 août 2017).

Voir aussi[modifier | modifier le code]

Articles connexes[modifier | modifier le code]

Entrez, le système global de recherches inter-bases de données du NCBI.
BLAST, un logiciel du NCBI, permettant la comparaison de séquences de nucléotides et de protéines.
La liste des pages Wikipédia décrivant un taxon utilisant une référence au NCBI.

Liens externes[modifier | modifier le code]

(en) Site officiel
Ressource relative à la recherche :
- ResearchGate
Notices d'autorité :
- VIAF
- ISNI
- LCCN
- GND
- Israël
- Catalogne
- Tchéquie
- WorldCat
(en) Site officiel
(en) Sa base de données taxonomique

[1] (en) « Disclaimer: The NCBI taxonomy database is not an authoritative source for nomenclature or classification - please consult the relevant scientific literature for the most reliable information. » (Voir bas de page sur cet exemple de recherche.)

[2] (en) « Home - Taxonomy », sur ncbi.nlm.nih.gov (consulté le 30 août 2017).

[3] (en) Scott Federhen, Karen Clark, Tanya Barrett et Helen Parkinson, « Toward richer metadata for microbial sequences: replacing strain-level NCBI taxonomy taxids with BioProject, BioSample and Assembly records », Standards in Genomic Sciences, vol. 9, n^o 3,‎ 15 juin 2014, p. 1275 (ISSN 1944-3277, DOI 10.4056/sigs.4851102, lire en ligne, consulté le 30 août 2017).

[4] (en) « International Nucleotide Sequence Database Collaboration », sur insdc.org (consulté le 30 août 2017).

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+Le '''''{{lang|en|National Center for Biotechnology Information}}''''' ('''NCBI''', littéralement {{En français|Centre américain pour les informations biotechnologiques}}) est un institut national américain pour l'[[Biologie moléculaire|information biologique moléculaire]].
+== Historique ==
 Cet organisme, fondé en [[1988]] et situé à [[Bethesda (Maryland)|Bethesda]] dans le [[Maryland]], fait partie de la [[United States National Library of Medicine|Bibliothèque américaine de médecine]], un des [[National Institutes of Health|Instituts américains de la santé]].
-Le NCBI propose et contient une base de données ''NCBI taxonomie'' qui n'est qu'indicative. Le site internet du NCBI précise que cette base n'est pas une source fiable pour la nomenclature ou de classification, et qu'il faut consulter la littérature scientifique pertinente pour les informations les plus fiables<ref>{{en}} {{Citation étrangère |langue=en |Disclaimer: The NCBI taxonomy database is not an authoritative source for nomenclature or classification - please consult the relevant scientific literature for the most reliable information.}} (Voir bas de page sur cet [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?id=137 exemple de recherche].)</ref>.
 == Missions ==
+Le NCBI conduit des recherches dans la biologie informatique, développe des logiciels pour analyser des données de [[génome]] et fournir des informations biomédicales.
-Le NCBI conduit des recherches dans la biologie informatique, développe des logiciels pour analyser des données de [[génome]] et fournir des informations biomédicales.
 Le NCBI n'est pas une base de données, mais il développe aussi des bases de données publiques telles que :
-* [[GenBank]]
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 Il est en quelque sorte le pendant américain de l’[[Institut européen de bio-informatique]] (EBI).
+Le NCBI propose et contient une [[base de données]] ''{{Langue|en|NCBI taxonomy}}'' qui n'est qu'indicative. Le site internet du NCBI précise que cette base n'est pas une source fiable pour la nomenclature ou de classification, et qu'il faut consulter la littérature scientifique pertinente pour les informations les plus fiables<ref>{{en}} {{Citation étrangère |langue=en |Disclaimer: The NCBI taxonomy database is not an authoritative source for nomenclature or classification - please consult the relevant scientific literature for the most reliable information.}} (Voir bas de page sur cet [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?id=137 exemple de recherche].)</ref>. La [[taxonomie]] du NCBI représente environ 10 % des espèces vivantes de la planète. Cette taxonomie est une classification curée et se propose comme une nomenclature organisée pour les séquences d'organismes dans des bases de données publiques<ref>{{Lien web|langue=en|titre=Home - Taxonomy |url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/taxonomy|site=ncbi.nlm.nih.gov|consulté le=2017-08-30}}.</ref>.
+Le TaxID (identifiant unique dans la taxonomie du NCBI) sert de lien entre les trois bases de données du ''{{Langue|en|International Nucleotide Sequence Database Collaboration}}'' (INSDC, {{En français|Collaboration internationale en bases de données de séquences nucléotidiques}})<ref>{{Article|langue=en|prénom1=Scott|nom1=Federhen|prénom2=Karen|nom2=Clark|prénom3=Tanya|nom3=Barrett|prénom4=Helen|nom4=Parkinson|titre=Toward richer metadata for microbial sequences: replacing strain-level NCBI taxonomy taxids with BioProject, BioSample and Assembly records |périodique=Standards in Genomic Sciences |volume=9 |numéro=3 |date=2014-06-15 |issn=1944-3277|doi=10.4056/sigs.4851102|lire en ligne=http://standardsingenomics.org/content/9/3/1275/|consulté le=2017-08-30|pages=1275}}.</ref> dont sont membres la ''[[DNA Data Bank of Japan]]'' (DDBJ), le NCBI ([[États-Unis]]) et l'[[Institut européen de bio-informatique]] (EMBL-EBI, Europe)<ref>{{Lien web|langue=en|titre=International Nucleotide Sequence Database Collaboration |url=http://www.insdc.org|site=insdc.org |consulté le=2017-08-30}}.</ref>.
 == Notes et références ==
+{{Références}}
-{{Références|colonnes=}}
 == Voir aussi ==
 === Articles connexes ===
 * [[Entrez]], le système global de recherches inter-bases de données du NCBI.
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 === Liens externes ===
+{{Liens}}
-* {{en}} [http://www.ncbi.nlm.nih.gov Site officiel]
-* {{en}} [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/ Sa base de donnée taxonomique]
+* {{en}} [https://www.ncbi.nlm.nih.gov Site officiel]
+* {{en}} [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/ Sa base de données taxonomique]
-{{Palette|Bio-informatique|Instituts américains de la santé}}
+{{Palette|Bio-informatique|Instituts américains de la santé|Base de données en biologie}}
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+{{Portail|biologie cellulaire et moléculaire|Maryland}}
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 [[Catégorie:Centre ou institut de recherche en biologie moléculaire]]
 [[Catégorie:Entreprise de biotechnologie ayant son siège aux États-Unis]]
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