« Paraphylie » : différence entre les versions

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En systématique, un groupe est dit paraphylétique quand il ne rassemble pas tous les descendants d'une espèce souche qu'il contient^[1].

Définitions[modifier | modifier le code]

Sens biologique[modifier | modifier le code]

Contrairement à la polyphylie, le groupe paraphylétique est fondé sur une similitude héritée d'un ancêtre commun (homologie). ^{[réf. souhaitée]} L'exclusion de certaines lignées nécessite de considérer les états ancestraux de certains caractères (encore appelé symplésiomorphie) par opposition à leurs états dérivés (ou synapomorphie) dans les lignées exclues.

Le groupe des reptiles (amniotes desquels ont été exclus les oiseaux et les mammifères) en est un exemple : les crocodiliens, inclus dans les reptiles, sont généalogiquement plus proches des oiseaux, exclus des reptiles, que des autres sauropsides (chéloniens, squamates et sphénodontiens) et les reptiles mammaliens, inclus, sont plus proches des mammifères, exclus, que des autres amniotes. L'ancêtre commun le plus proche de tous les reptiles est également l'ancêtre commun le plus proche des oiseaux, des mammifères et des reptiles. Le groupe des reptiles ainsi défini est donc paraphylétique.

    amniotes
       ├─Synapsides
       │    ├─Mammifères
       │    └─Reptiles mammaliens----------|
       |
       └─Sauropsides
            ├─Chéloniens-------------------|
            │                              |  « Reptiles »
            └─Diapsides--------------------|
                ├─Lépidosauriens-----------|
                │    ├─Squamates-----------|
                │    └─Sphénodontiens------|
                │                          | 
                └─Archosauriens            |
                     ├─Crocodiliens--------|
                     └─Oiseaux

Note : Les crustacés, les amphibiens ou les poissons sont d'autres exemples de groupes paraphylétiques.

Propriétés mathématiques[modifier | modifier le code]

En théorie des graphes, on peut définir le « degré de paraphylie » d'un groupe comme étant le nombre minimum de branches qu'il faudrait retirer à un groupe holophylétique^[1]. Un groupe holophylétique a donc un degré de paraphylie de zéro.

La définition traditionnelle des reptiles (sauropsides + synapsides) en fait un groupe ayant un degré de paraphylie de 2, puisqu'il faut retirer au groupe des amniotes la branche des mammifères et celle des oiseaux.

Exemples[modifier | modifier le code]

Les procaryotes (excluent les eucaryotes)
Les microorganismes
Les préspermaphytes
Les herbes
Les invertébrés
Les crustacés (excluent les insectes)
Les poissons (excluent les tétrapodes)
Les amphibiens (excluent les amniotes)
Les reptiles (excluent les oiseaux et les mammifères)
Les antilopes (excluent les bovins et caprins)
Les reptiles mammaliens (incluent tous les synapsides sauf les mammifères, qui en sont exclus)
Les micromammifères
Les renards
Les singes (Débat concernant l'inclusion, ou non, de l'humain dans ce groupe ; il peut, donc, être aussi vu comme monophylétique, ce qui va donner au groupe des simiens).

Statut de la paraphylie[modifier | modifier le code]

Pour les cladistes, les taxons paraphylétiques sont inacceptables dans la classification. Au contraire pour les évolutionnistes il n'y a aucun problème dans le fait d'accepter de tels taxons. Selon la définition qui en est donnée (voir l'article Monophylie), la paraphylie est parfois considérée comme une forme de monophylie.

Voir aussi[modifier | modifier le code]

Termes associés :

Concepts associés :

Notes et références[modifier | modifier le code]

↑ ^{a et b} Aubert, D. 2015. A formal analysis of phylogenetic terminology: Towards a reconsideration of the current paradigm in systematics. Phytoneuron 2015-66:1–54. https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01240878v1

Portail origine et évolution du vivant

[aub15-1] {a et b} Aubert, D. 2015. A formal analysis of phylogenetic terminology: Towards a reconsideration of the current paradigm in systematics. Phytoneuron 2015-66:1–54. https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01240878v1

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 {{homophonie| Paraphilie}}
 {{à sourcer|date=février 2013}}
-{{ébauche|origine et évolution du vivant}}
-[[Image:Paraphyletic2.svg|thumb|350px|Le groupe paraphylétique des [[reptile]]s apparaît en bleu. Ce groupe comprend un ancêtre et une partie de ses descendants mais pas tous. |alt=Arbre d’évolution. Les reptiles sont un groupe paraphylétique. Ce groupe comprend un ancêtre et une partie de ses descendants mais pas tous. ]]
+[[File:Traditional Reptilia.jpg|thumb|350px|Le groupe traditionnel paraphylétique des [[reptile]]s apparaît en vert. Ce groupe comprend un ancêtre et une partie de ses descendants mais pas tous puisque les [[oiseau]]x et les [[Mammifère|mammifères]] en sont exclus. C'est un groupe paraphylétique de degré deux. |alt=Arbre d’évolution. Ce groupe comprend un ancêtre et une partie de ses descendants mais pas tous puisque les [[oiseau]]x et les [[Mammifère|mammifères]] en sont exclus. C'est un groupe paraphylétique de degré deux.]]
-En [[systématique]], un groupe est dit '''paraphylétique''' quand il ne rassemble pas tous les descendants d'une espèce souche<ref name="aub15">Aubert, D. 2015. A formal analysis of phylogenetic terminology: Towards a reconsideration of the current paradigm in systematics. ''Phytoneuron'' '''2015-66''':1–54.</ref>. Contrairement à la [[polyphylie]], le groupe paraphylétique est fondé sur une similitude héritée d'un ancêtre commun ([[homologie (évolution)|homologie]]). {{refsou}} L'exclusion de certaines lignées nécessite de considérer les [[Caractère ancestral et caractère dérivé|états ancestraux]] de certains caractères (encore appelé [[symplésiomorphie]]) par opposition à leurs [[Caractère ancestral et caractère dérivé|états dérivés]] (ou [[synapomorphie]]) dans les lignées exclues.
+En [[systématique]], un groupe est dit '''paraphylétique''' quand il ne rassemble pas tous les descendants d'une [[Souche (biologie)|espèce souche]] qu'il contient<ref name="aub15">Aubert, D. 2015. A formal analysis of phylogenetic terminology: Towards a reconsideration of the current paradigm in systematics. ''Phytoneuron'' '''2015-66''':1–54. https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01240878v1</ref>.
+== Définitions ==
-Le groupe des [[reptile]]s en est un exemple : les [[crocodilien]]s sont généalogiquement plus proches des [[oiseau]]x (''Aves'') que des autres [[sauropside]]s ([[chélonien]]s, [[squamate]]s et [[sphénodontiens]]). Cependant les [[crocodilien]]s sont inclus dans les reptiles avec les autres sauropsides cités, alors que les « oiseaux » en sont exclus. L'ancêtre commun le plus proche à tous les reptiles est également l'ancêtre commun le plus proche des oiseaux et des reptiles. Les reptiles ainsi définis sont donc paraphylétiques.
+=== Sens biologique ===
+Contrairement à la [[polyphylie]], le groupe paraphylétique est fondé sur une similitude héritée d'un ancêtre commun ([[homologie (évolution)|homologie]]). {{refsou}} L'exclusion de certaines lignées nécessite de considérer les [[Caractère ancestral et caractère dérivé|états ancestraux]] de certains caractères (encore appelé [[symplésiomorphie]]) par opposition à leurs [[Caractère ancestral et caractère dérivé|états dérivés]] (ou [[synapomorphie]]) dans les lignées exclues.
+Le groupe des [[reptile]]s ([[Amniota|amniotes]] desquels ont été exclus les [[oiseau]]x et les [[Mammifère|mammifères]]) en est un exemple : les [[Crocodilia|crocodiliens]], inclus dans les reptiles, sont généalogiquement plus proches des [[oiseau]]x, exclus des reptiles, que des autres [[Sauropsida|sauropsides]] ([[Tortue|chéloniens]], [[Squamata|squamates]] et [[Rhynchocephalia|sphénodontiens]]) et les reptiles mammaliens, inclus, sont plus proches des mammifères, exclus, que des autres [[Amniota|amniotes]]. L'ancêtre commun le plus proche de tous les reptiles est également l'ancêtre commun le plus proche des oiseaux, des mammifères et des reptiles. Le groupe des reptiles ainsi défini est donc paraphylétique.
-     [[Sauropsides]]
-        ├─'''[[Chéloniens]]'''-------------------|
-        │                              |
-        └─[[Diapsides]]--------------------|
-            ├─'''[[Lépidosauriens]]'''-----------|
-            │    ├─'''[[Squamates]]'''-----------|  « '''[[Reptiles]]''' »
-            │    └─'''[[Sphénodontiens]]'''------|
-            │                          |
-            └─[[Archosauriens]]            |
-                 ├─'''[[Crocodiliens]]'''--------|
-                 └─[[Oiseau]]x
+     [[Amniota|amniotes]]
-{{Souligner|Note :}} Les [[amphibiens]], les [[poisson]]s et les [[invertébré]]s sont d'autres exemples de groupes paraphylétiques.
+        ├─[[Synapsida|Synapsides]]
+        │    ├─[[Mammifère|Mammifères]]
+        │    └─[[Synapsida#Les « reptiles mammaliens »|Reptiles mammaliens]]----------|
+        |
+        └─[[Sauropsida|Sauropsides]]
+             ├─'''[[Tortue|Chéloniens]]'''-------------------|
+             │                              |  « '''[[Reptile|Reptiles]]''' »
+             └─[[Diapsida|Diapsides]]--------------------|
+                 ├─'''[[Lepidosauria|Lépidosauriens]]'''-----------|
+                 │    ├─'''[[Squamata|Squamates]]'''-----------|
+                 │    └─'''[[Rhynchocephalia|Sphénodontiens]]'''------|
+                 │                          |
+                 └─[[Archosauria|Archosauriens]]            |
+                      ├─'''[[Crocodilia|Crocodiliens]]'''--------|
+                      └─[[Oiseau]]x
+{{Souligner|Note}} : Les [[crustacés]], les [[Amphibia|amphibiens]] ou les [[poisson]]s sont d'autres exemples de groupes paraphylétiques.
-== Statut de la paraphylie ==
+=== Propriétés mathématiques ===
-Pour les [[Cladisme|cladistes]], les [[taxon]]s paraphylétiques sont inacceptables dans la classification. Au contraire pour les [[Évolutionnisme (biologie)|évolutionnistes]] il n'y a aucun problème dans le fait d'accepter de tels [[taxon]]s. Selon la définition qui en est donnée (voir l'article [[Monophylie]]), la paraphylie est parfois considérée comme une forme de [[monophylie]].
+En [[théorie des graphes]], on peut définir le « degré de paraphylie » d'un groupe comme étant le nombre minimum de branches qu'il faudrait retirer à un groupe [[Monophylie|holophylétique]]<ref name="aub15" />. Un groupe holophylétique a donc un degré de paraphylie de zéro.
+La définition traditionnelle des reptiles ([[Sauropsida|sauropsides]] + [[Synapsida|synapsides]]) en fait un groupe ayant un degré de paraphylie de 2, puisqu'il faut retirer au groupe des [[Amniota|amniotes]] la branche des [[mammifère]]s et celle des [[oiseau]]x.
-==Voir aussi==
+== Exemples ==
+* Les [[Prokaryota|procaryotes]] (excluent les [[Eukaryota|eucaryotes]])
+* Les [[Micro-organisme|microorganismes]]
+* Les [[préspermaphytes]]
+* Les [[herbe]]s
+* Les [[invertébré]]s
+* Les [[crustacés]] (excluent les [[insecte]]s)
+* Les [[poisson]]s (excluent les [[Tetrapoda|tétrapodes]])
+* Les [[Amphibia|amphibiens]] (excluent les [[Amniota|amniotes]])
+* Les [[reptile]]s (excluent les [[oiseau]]x et les mammifères)
+* Les [[antilopes]] (excluent les [[Bovini|bovins]] et [[Caprinae|caprins]])
+* Les reptiles mammaliens (incluent tous les [[Synapsida|synapsides]] sauf les mammifères, qui en sont exclus)
+* Les [[micromammifère]]s
+* Les [[renard]]s
+* Les [[singe]]s (Débat concernant l'inclusion, ou non, de l'humain dans ce groupe ; il peut, donc, être aussi vu comme [[Monophylie|monophylétique]], ce qui va donner au groupe des [[simien]]s).
+== Statut de la paraphylie ==
+Pour les [[Classification phylogénétique|cladistes]], les [[taxon]]s paraphylétiques sont inacceptables dans la classification. Au contraire pour les [[Systématique évolutionniste|évolutionnistes]] il n'y a aucun problème dans le fait d'accepter de tels [[taxon]]s. Selon la définition qui en est donnée (voir l'article [[Monophylie]]), la paraphylie est parfois considérée comme une forme de [[monophylie]].
+== Voir aussi ==
 Termes associés :
+* [[Hétérophylie|hétérophylétique]] ;
-* [[Monophylétique|Holophylétique et monophylétique]]
+* [[Monophylie|holophylétique et monophylétique]] ;
-* [[Polyphylétique]]
+* [[Polyphylie|polyphylétique]].
 Concepts associés :
-* [[Taxinomie]]
+* [[Taxonomie|taxinomie]] ;
-* [[Arbre phylogénétique]]
+* [[taxon poubelle]] ;
+* [[arbre phylogénétique]] ;
-* [[Évolutionnisme (biologie)]]
+* [[Systématique évolutionniste|évolutionnisme (biologie)]] ;
-* [[Cladisme]]
+* [[Classification phylogénétique|cladisme]].
-== Références ==
+== Notes et références ==
+{{Références}}
-<references />
 {{portail|origine et évolution du vivant}}
 [[Catégorie:Phylogénétique]]